@article { author = {Estoepangestie, A. T. Soelih and Dewi, Arini and Suwarno, Suwarno and Handijatno, Didik and Ernawati, Rahaju and Tyasningsih, Wiwiek}, title = {Molecular analysis of ompA gene Pasteurella multocida Indonesia local isolates}, journal = {Iraqi Journal of Veterinary Sciences}, volume = {35}, number = {2}, pages = {211-216}, year = {2021}, publisher = {College of Veterinary Medicine / University of Mosul}, issn = {1607-3894}, eissn = {2071-1255}, doi = {10.33899/ijvs.2019.125934.1191}, abstract = {The aim of this research was to analyze ompA molecular gene of Pasteurella multocida buffalo isolate and bovine isolate from Nusa Tenggara Timur, Indonesia and Katha strain isolate from hemorrhagic septicemia vaccine. Determinant of P. multocida local isolates ompA gene amplification sequencing PCR then conducted to see the sequence of nucleotide sequences of ompA gene. The results of PCR amplification showed an amplicon of 559 bp of all isolates. The homology analysis result of the isolates ranged from 93 - 100% with 13 P. multocida isolates from GenBank, and phylogenetic tree analysis shows that buffalo isolate was closely related to Katha strain, Iran, India and China isolate. Whereas bovine isolate far enough with buffalo and Katha strain isolate. Nucleotide sequences were compared to amino acids then by the method of Kolaskar and Tongaonkar antigenicity predicted antigens in P. multocida. B cell epitope predictions from local isolates and Katha strain were found in five peptides QVSPVFAG, IPELALRVEYQ, GQSVYVPEVVSKT, LKSASVAVAG, and ANYLVAKG.}, keywords = {Pasteurella multocida,ompA gene,nucleotide,local isolate}, title_ar = {التحلیل الجزیئی لجین ompA للعزلات المحلیة لجرثومة Pasteurella multocida فی إندونیسیا}, abstract_ar = { الهدف من هذا البحث هو التحلیل الجزیئی لجین ompA لجرثومة Pasteurella multocida المعزولة من الجاموس والابقار فی نوسا تی نغارا تیمور، إندونیسیا وسلالة کاثا المعزولة من لقاح تسمم الدم النزفی. تم تضخیم العزلة المحلیة لجرثومة P. multocida  المحددة بواسطة تفاعل البلمرة المتسلسل ثم أجری تسلسل القواعد النیتروجینیة لجین ompA.  وأظهرت نتائج التضخیم للقطعة المراد تضخیمها ودراستها بوزن جزیئی 559 زوج قاعدی فی جمیع العزلات. تراوحت نتائج تحلیل التشابهه لتسلسل 13 عزلة من العزلات مع تسلسل العزلات المثبتة فی بنک الجینات وبمدى 93- 100٪ ، وتحلیل شجرة المظهریة الجینیة لعزلات الجاموس کانت ذات علاقة وثیقة مع عزلات کاثا وإیران والهند والصین. فی حین کانت عزلات الابقار بعیدة کل البعد عن عزلات الجاموس وکاثا. تم مقارنة تسلسل القواعد النیتروجینیة النیوکلیوتیدات مع الأحماض الأمینیة ثم عن طریق طریقة کولاسکار وتونغونکار المستضدیة المتوقعة فی مستضدات P. multocida. تم العثور على تنبؤات الخلیة B من العزل المحلیة وسلالة کاثا فی خمس الببتیدات QVSPVFAG ، IPELALRVEYQ، GQSVYVPEVVSKT، LKSASVAVAG، و ANYLVAKG.}, keywords_ar = {}, url = {https://www.vetmedmosul.com/article_164501.html}, eprint = {https://www.vetmedmosul.com/article_164501_81d7a09bfc3f14062534ab716b61e6d7.pdf} }